主人公凌菲是一个略带“公主病”的小千金，被父母送到了一个古怪的训练营里打发暑假。在这个古怪的训练营里凌菲认识了电脑神童艾丁，俩人很快成为了好朋友；
　　某天夜里，凌菲独自一人出来散步，偶遇了从天而降的小飞猪。凌菲觉得它很可爱就把它带回了宿舍。从此，凌菲带着小飞猪一起参加训练营的各种活动。
　　一天小飞猪闯进了教授古拉法的实验室里，跟教授捣乱，觉得教授的实验室里非常好玩，准备下次带凌菲他们一起来玩。于此同时，由外星势力老大派来的两只外星虫子偷偷潜入了训练营，准备偷取藏在教授实验室里的时空法器。小飞猪带着凌菲等人来到教授古拉法的实验室，却发现教授受了伤，并指知道了教授的真实身份。原来古拉法是活了上千年的魔法老师，一直掌握着守护开启魔法时空门的使命！
　　教授的无私感染了小孩子们，于是，凌菲等人决定帮助教授抢回装有时空法器的保险箱。最终，在法力无边的小飞猪的帮助下，外星生物的计划彻底落空了。教授并没有采用暴力手段对付两只外星虫子，而是决定开启时空之门，送外星虫回去；经过了此番波澜，训练营里的所有人都开始“长大”，所有人都得到了新的启迪与感悟。
　　同时，小飞猪也完成了此次猪猪星球派给他的“天使任务”。小飞猪望着大家恋恋不舍，最后化成一道光穿梭天空……

人类没有了咏唱，就不能使用魔术。 　　但是，有一个少女，把不可能变成了可能。 　　利迪尔王国魔术师的巅峰七贤人之一“沉默的魔女”莫妮卡·埃瓦雷特。 　　是史上第一个创造出无咏唱魔术的年轻天才。 　　但是…因为极度怕生而怯场的她，和使魔黑猫躲在深山里， 　　被公式书包围着，静静地埋头于魔术的研究。 　　在这样的情况下，七贤人的同事“结界的魔术师”路易斯·米莱来访。 　　路易斯对不知所措的她宣告了一条王命。 　　那就是——潜入贵族聚集的名校，护卫第二王子的绝密任务……。

　　面积占东京都西部1/3、人口超过230万、八成以上由学生组成的学园都市，尖端科技发展迅速，超能力开发已经深入到城市的各个角落。超能力水平高达Level 5的御坂美琴（佐藤利奈 配音）如往常一样和初春饰利（丰崎爱生 配音）、白井黑子（新井里美 配音）等好友过着平凡的日子，间或热血爆发挫败各种扰乱城市的阴谋。某天，在调查一起现今卡事件时她邂逅了长点上机学园的布束砥信（叶山郁美 配音），从而得知用美琴的DNA大批量复制超能力者的“量产型能力者计划”。不安定的气氛在都市角落肆意蔓延……                                    
　　本片为镰池和马（原作）、冬川基（作画）的原作《魔法禁书目录》的外传漫画第二季TV动画。

在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者  。 　　在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 　　在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 　　愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 　　愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。

当马克被迫面对自己的过去和未来时，一切都发生了变化，同时他发现还需要走多远才能保护他所爱的人。