《彗星路西法》讲述闪耀着蓝色光辉的矿石吉夫特矿石所覆盖的大地，行星吉夫特。宗吾天城是住在因吉夫特矿石采掘而繁荣的小镇，靛蓝花园的纯朴少年。以收集稀少矿石为乐趣的宗吾，某天被卷入同级生卡恩、罗曼、欧特等人引发的骚动，迷失在矿山深处的地底湖。在那里，宗吾遇到了一位不可思议的少女随风飘逸的蓝色长发，直直凝视的红色瞳孔。她究竟是什么人，这次邂逅给宗吾带来了什么？随后，缔结的羁绊将打开通往冒险的大门。
故事发生在一个依靠着音乐才赖以生存的地方都市之中，音羽歌苗（小松未可子 配音）是一位平凡的高中一年级学生，本来出生在显赫世家的千金大小姐，却因为父母的不断挥霍而不得不早于同龄人许多步，开始思考起自己未来的生计问题。一天，歌苗的面前忽然出现了两名可疑的男子，让歌苗没有想到的是，这两个人，是大名鼎鼎的音乐家贝多芬（杉田智和 配音）和莫扎特（梶裕贵 配音）。 在两人所组成的乐队Classicaloid演奏时，产生了奇妙的力量，让整个城市都陷入了沸腾之中。之后，肖邦（鸟海浩辅 配音）、李斯特（能登麻美子 配音）、舒伯特（前野智昭 配音）和瓦格纳（松冈祯丞 配音）等音乐奇才纷纷现身。
