这是一个跨越千年的故事。以表演人偶为生的青年国崎往人（小野大辅 配音）行走到了一个海边的小镇。四处游走的往人一直在寻找着“空中的少女”，这是往人的母亲逝世前曾一直对他说的话。原来流传着这样一个故事。有着翅膀的女孩被视为不幸的象征，终日被关在不见光的房间里，直到遇到那个命定的少年。二人就这样相爱了，但这恋情是不被允许的。于是女孩受到诅咒，陷入了轮回之中。往人在小镇里邂逅了少女神尾观铃（川上伦子 配音）。体弱多病的观铃和传说中的女孩极其相似。而他们的相遇如同千年前的那个传说，轮回的齿轮又开始了不休的运作…… 本片根据Key社著名的同名游戏改编，还有同名剧场版动画。
故事发生在名为“小鸟游事务所”的偶像事务所之中，这里是孵化未来闪耀着耀眼光辉的偶像的巢穴。 外表冷漠但内心却隐藏着巨大的热情的和泉一织（增田俊树 配音）、非常讨厌演艺圈里的歪风邪气的二阶堂大和（白井悠介 配音）、心思细腻十分懂得为他人着想的和泉三月（代永翼 配音）、身体协调能力非常出色，台上台下判若两人的四叶环（大桥贤一郎 配音）、个性认证又温柔，对人对事有着强烈责任感的逢坂壮五（阿部敦 配音）、身世十分复杂，外貌超群的六弥凪（江口拓也 配音）和总是无法拒绝他人请求的老好人七濑陆（小野贤章 配音），这七人聚集在事务所中，共同向着梦想努力。
普通男子高中生加贺谷修一可以变身为怪物但并不是普通的怪物，而是布偶怪物，而且还是少女进入他的身体控制。这样过着日常生活的他，所热爱的日常，某天开始却突然不复存在……
《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫画《游戏王》，于2000-2004年之间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主，但因为中途漫画故事情节进度跟不上，故加插大量漫画没有的剧情和人物。此举为脱离“原作”独立创作故事奠定下基础。 决斗者王国篇 一卷神秘的录像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝卡斯·J·克罗佛多在录像带中使用黑暗决斗向武藤游戏挑战，但武藤游戏却因为时间终止而败北，武藤双六的灵魂也因此被千年眼的力量封印在灵魂封印卡中（漫画版为贝卡斯寄给游戏的录像带），武藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与伙伴们前往决斗者王国找贝卡斯决斗，与互信的伙伴们以及心中的另一个自己并肩作战。 战斗城市前篇 决斗者王国一战结束，武藤游戏的知名度瞬间上升，神秘的埃及石板来到日本展览，牵扯出千年神器的秘密、三千年前的战斗、三张神之卡，还有隐藏在千年积木中的无名法老王的记忆，海马濑人在一...
席卷全球的战斗——《狂野猛兽》最强争霸赛即将开战，分布在全世界各地的赛场免费向所有人开放，而冠军则可以获得高达500万日元的大奖。为了证明谁是最强，琦玉和对手们在VR的世界里开始对决。
